La certification et l'interopérabilité sont essentielles à la technologie EPC pour réussir l'implémentation de celle-ci. Les entreprises intégrant EPC à leur chaîne d'approvisionnement, doivent disposer de tags et de lecteurs fonctionnant de la même manière que ceux de leurs partenaires commerciaux et les différents éléments du Réseau EPC doivent inter-opérer avec les pratiques commerciales et applications existantes. C'est pourquoi EPCglobal attache beaucoup d'importance à l'élaboration des spécifications techniques pour chaque élément individuel du système EPC, et que en ce faisant une attention particulière est donnée aux interfaces entre les différents composants du système. A cet effet, GS1 collabore étroitement avec les Auto-ID Labs et avec les fournisseurs de solutions, siégeant dans les Action Groups d'Equipement et de Logiciel de EPCglobal. Ils visent ainsi à garantir la disponibilité de produits compatibles EPC et l'interopérabilité avec les systèmes existants.
Par ailleurs EPCglobal permet aux Fournisseurs de Solutions de certifier leurs produits (voir programme de certification EPCglobal). Le site de EPCglobal reprend également des listes de tous les produits EPC/RFID certifiés à ce jour.