Il appartient à l'utilisateur de faire son bilan des coûts et profits et d'en tirer les conclusions. Les désavantages d'eCom se situent surtout au niveau des obligations et des innovations que l'adoption d'eCom entraîne. Une règle de base dit qu'eCom ne sera une réussite que s'il génère une situation win-win et que si la direction d'entreprise est convaincue de sa nécessité.